（1）正常工厂有一套完整的生产线，能够生产出已经剥好糖纸的“铁撬”（活性香豆素苷元，是一种铁螯合剂）。这些铁撬能直接螯合锁住铁的保险柜里的铁，把铁“拉”出来，让工厂顺利拿到铁。

（2）工厂里的一个关键零件（CSE酶）坏了，导致生产线出了问题。现在工厂只能生产出被糖纸包裹着的铁撬（香豆素糖苷，无螯合活性）。这些带糖纸的铁撬没法螯合铁，工厂陷入铁资源短缺，生产停滞，产品发黄。

（3）工厂虽然只能生产带糖纸的铁撬，但这些“半成品”散发出的气味（糖基化代谢物）吸引了一群工人（根际细菌）。工人们自带“剥糖纸机”（β-葡萄糖苷酶），把铁撬上的糖纸剥掉，铁撬恢复了螯合铁的能力。激活后的铁撬就能从保险柜里把铁拉出来，让工厂重新拿到铁。

摘要

（1）Root specialized metabolites (RSMs) comprise diverse, functional, plant-derived small molecules that can shape plant fitness by modulating rhizosphere microbe community, although the ecological functions and dynamics of RSM–microbe interactions remain elusive. 根系特异性代谢物包含多种多样、具有功能性的植物来源小分子，它们能够通过调控根际微生物群落来影响植物的适合度，尽管RSM-微生物互作的生态功能和动态变化仍不明确。

（2）Here, to explore how metabolic alterations influence microbiota assembly, we applied systematic multi-omics, phenotypic, and functional profiling of growth phenotypes, root metabolomes, and rhizosphere microbiota in 16 Arabidopsis thaliana mutants, defective in four distinct specialized metabolic pathways, under alkaline agricultural soil conditions.在此，为了探究代谢变化如何影响微生物群落的组装，我们在碱性农业土壤条件下，对16个拟南芥突变体（这些突变体在4条不同的特异性代谢通路上存在缺陷）进行了系统的多组学、表型和功能分析，包括生长表型、根系代谢组和根际微生物组。

（3）This paradigm identified genotype-enriched, rather than pathway-specific, correlations between RSMs and microbes.这一研究范式发现，RSM与微生物之间的相关性是基因型富集型的，而非通路特异性的。

（4）Notably, the cse-2 lignin biosynthesis mutant exhibited chlorosis and growth retardation under iron-deficiency, accompanied by decreased coumarins, but increased aromatic glycosides, with enrichment of Actinobacteria and Pseudomonadota taxa harboring aromatic compound-degrading pathways.值得注意的是，在缺铁条件下，木质素生物合成突变体cse-2表现出黄化和生长迟缓，同时伴随香豆素含量降低、芳香糖苷含量升高，并富集了携带芳香化合物降解途径的放线菌门和假单胞菌门类群。

（5）Co-incubation of root exudates with a synthetic microbial community demonstrated that microbial deglycosylation predominantly underlies the dynamic transformation of such RSMs.将根系分泌物与合成微生物群落共培养表明，微生物介导的去糖基化是这类RSM动态转化的主要驱动力。

（6）Additionally, we identified a secreted β-glucosidase (A594_07591) in these microbes that preferentially hydrolyzes coumarin glycosides.此外，我们在这些微生物中鉴定出一种分泌型的β-葡萄糖苷酶（A594_07591），该酶能够优先水解香豆素糖苷。

（7）Inoculation with Pseudomonas simiae WCS417r heterologously expressing A594_07591 significantly alleviated the iron-deficiency plant phenotype by converting catecholic coumarin glycosides to aglycones.接种异源表达A594_07591的Pseudomonas simiae WCS417r，通过将儿茶酚型香豆素糖苷转化为苷元，显著缓解了植物的缺铁表型。

（8）This study uncovers a cooperative plant–microbe mechanism that transforms coumarins to promote iron acquisition under alkaline conditions and underscores the dynamic remodeling of RSMs in the rhizosphere as a key driver of plant fitness under environmental stress.本研究揭示了一种植物-微生物协同机制，该机制在碱性条件下通过转化香豆素来促进铁的吸收，并强调了根际RSM的动态重塑是环境胁迫下植物适合度的关键驱动因素。

（9）Result

（10）Arabidopsis mutants in plant specialized metabolite pathways exhibit distinct rhizosphere microbiota composition植物特异性代谢通路缺陷的拟南芥突变体表现出差异性的根际微生物群落组成

（11）Defective CSE function causes coumarin deficiency and iron-starvation chlorosis in agricultural soil CSE 功能缺陷导致农业土壤中香豆素缺乏及缺铁性黄化

（12）Root aromatic exudates link cse mutation to root microbes in agricultural soil 根系芳香族分泌物将cse突变与农业土壤中的根系微生物联系起来

展示cse-2突变体招募的根际细菌在低铁条件下增强植物生长。通过Sankey图（图3A）关联了cse-2突变体中富集的微生物、代谢物和功能。进一步的生长曲线实验（图3C）证实了，cse-2根际中积累的某些“芳香化合物”（原文以5-O-咖啡酰莽草酸、咖啡酸、伞形酮为例）能够促进从该环境中分离的部分根际细菌的生长

（13）Rhizobacterial hydrolysis of coumarin glycosides enhances plant iron uptake 根际细菌对香豆素糖苷的水解增强植物对铁的吸收

（14）Engineered WCS417r expressing A594_07591 liberates iron-mobilizing coumarin aglycones. 表达A594_07591的工程化WCS417r菌株释放具有铁动员活性的香豆素苷元

根系特异性代谢物包含多种多样、具有功能性的植物来源小分子，它们能够通过调控根际微生物群落来影响植物的适合度，尽管RSM-微生物互作的生态功能和动态变化仍不明确。