1）未来的研究重点应从“分离有益菌”转向“调控定殖过程

（2）PTI（PAMP触发免疫）和ETI（效应因子触发免疫）它们可能通过某些激酶（MAPKKK等）、钙离子信号以及SGT1等辅助蛋白汇聚到一起，共同决定植物免疫反应的强度与类型

（3） 植物免疫的“启动流程”：当植物细胞表面的“哨兵蛋白”——模式识别受体（PRRs）识别到病原菌的分子模式后，会立刻招募一个关键的“助手蛋白”叫做BAK1。两者结合形成受体复合物，并激活下游的一类“传令兵”蛋白激酶RLCK（比如BIK1）。随后，这些被激活的“传令兵”会去磷酸化（即激活）两个关键的“执行者”：RBOHD：负责产生活性氧，直接杀死或抑制入侵的微生物。MAPKKKs：作为MAPK级联通路的起点，最终引发一系列连锁反应

（3）细菌利用效应蛋白攻击免疫信号的关键“枢纽”BIK1和BAK1，瘫痪MAPK级联通路【下游包括，激活特定的转录因子,诱导防御基因表达,内置的负反馈调控机制,促进乙烯和ABA信号,介导气孔免疫与ROS爆发】，有益的根瘤菌也会使用效应蛋白来调节植物免疫，但目的是为了共生。

（3）微生物在附着到根表后，如何避免被植物的免疫系统：改变或隐藏自身的“身份标签”；利用共生信号“压制”局部免疫【结瘤因子】；

（4）微生物对免疫应答的耐受：主动中和策略：抑制植物防御物质的分泌，抑制活性氧的产生；被动适应策略：微生物会分泌胞外多糖等物质，解毒植物产生的抗菌物质；主动寻找免疫“薄弱点”定殖

摘要：

（1）The rhizosphere, as the “frontline” of plant life, connects plant roots, rhizosphere microorganisms, and surrounding soil, plays a crucial role in plant growth and health, particularly in sustainable agriculture. 根际作为植物生命的“前线”，连接着植物根系、根际微生物以及周围土壤，在植物生长和健康（特别是在可持续农业中）扮演着至关重要的角色。

（2）Despite the well-established contribution of plant-microbe interactions to plant health, the specific molecular mechanisms remain insufficiently understood.尽管植物-微生物相互作用对植物健康的贡献已得到充分证实，但其具体的分子机制仍未被充分理解。

（3）This review aims to summarize the physiological adjustments and signal modulation that both plants and microorganisms undergo within this unique ecological niche to ensure successful colonization.本综述旨在总结植物和微生物为了在这个独特的生态位中确保成功定殖而进行的生理调整和信号调控。

（4）By analyzing key processes such as chemotaxis, root attachment, immune evasion, and biofilm formation, we uncover how plants precisely modulate root exudates to either recruit or repel specific microorganisms, thereby shaping their colonization patterns.通过分析趋化性、根部附着、免疫逃逸和生物膜形成等关键过程，我们揭示了植物如何精确调节根系分泌物以招募或排斥特定的微生物，从而塑造其定殖模式。

（5）These findings provide new insights into the complexity of plant-microbe interactions and suggest potential directions for future research in sustainable agriculture.这些发现为理解植物-微生物相互作用的复杂性提供了新的见解，并为未来可持续农业的研究指出了潜在方向。

（6）Result

细菌在植物根部定殖的完整过程。简单来说，整个过程分为几步：细菌首先通过趋化性“闻”到植物根系分泌物的味道，主动向根部游动；接着附着在根表面；之后细菌必须想办法逃避植物的免疫攻击才能存活下来；最后，细菌会利用根系分泌物作为营养来源，形成一层保护性的生物膜，从而在根际或根表面稳定地“安家落户”。在这个过程中，植物通过根系分泌物来影响哪些细菌能定殖，双方会进行复杂的分子信号交流，这说明植物与微生物之间的关系是双向且精细调控的

（7）Chemotactic signals emitted by plants roots 植物根系发出的趋化信号

根际微生物趋化性的分子模型，简单来说就是细菌如何“闻”到植物根部分泌的化学物质并决定游向哪里。植物根系分泌的化合物对有益菌是“诱饵”，对有害菌是“驱避剂”。这些物质被细菌表面的跨膜化学受体（MCP）感知后，通过CheW蛋白激活CheA，使其发生自磷酸化。磷酸化的CheA再把磷酸基团传给CheY蛋白，生成的CheY-P会结合到鞭毛马达上，促使鞭毛的旋转方向从逆时针（直线游动）切换为顺时针（原地翻滚或转向），从而改变细菌的运动轨迹。CheZ负责快速去除CheY-P的磷酸基团，及时终止信号。同时，CheB和CheR通过调节受体的甲基化水平，帮助细菌适应持续的化学信号梯度。整个过程就像一套精密的导航系统，让细菌能够根据根部释放的化学信号，精准地向营养物质丰富或适合定殖的位置移动。

（8）Chemotactic signal reception and response by microorganisms 微生物的趋化信号接收和反应

（9）Bacterial attachment to root surfaces 细菌附着在根表

（10） Bacterial immune recognition evasion 细菌免疫识别逃避

植物对抗细菌病原体的两条主要免疫信号通路：PTI（PAMP触发免疫）和ETI（效应因子触发免疫），以及它们之间的相互联系。简单来说，图中用浅蓝色箭头表示的模式识别受体信号通路，是植物的“基础防线”。当植物细胞表面的PRR受体识别到细菌的通用分子模式（MAMPs）后，会激活一系列信号传导，比如通过BAK1、RBOHs、MAPK级联反应等，最终引发免疫应答。

而紫色箭头表示的是核苷酸结合富亮氨酸重复受体信号通路，是更特异、更强的“第二道防线”。当病原菌通过效应因子（T3Es）试图抑制PTI时，植物细胞内的NLR受体会直接或间接识别这些效应因子，从而触发更强烈的ETI反应。

图中最关键的信息是，这两条通路并非独立工作，而是在多个节点上相互连接和协同调控（图中用紫蓝混合色的箭头表示）。例如，它们可能通过某些激酶（MAPKKK等）、钙离子信号以及SGT1等辅助蛋白汇聚到一起，共同决定植物免疫反应的强度与类型。

总的来说，这幅图清晰地概括了植物免疫系统的“双重防御”模式：一层在细胞表面识别通用入侵信号，另一层在细胞内识别病原菌的具体攻击武器，两者精密配合，为植物提供全方位的保护。

（11） Bacterial effectors interfere with immune signaling 细菌效应器干扰免疫信号

（12） Microbial tolerance to immune responses

（13） Biofilm formation and stable colonization 生物膜形成和稳定定居

尽管植物-微生物相互作用对植物健康的贡献已得到充分证实，但其具体的分子机制仍未被充分理解。